Süryani Patrikliğinin ilk merkezi Antakya’dır. Mor Petrus (Şemun) tarafından M.S. 37- 43 yılları arasında kuruldu.

518 yılına kadar Antakya’da kalan Patriklik merkezi daha sonra geçici olarak birçok yerlere ve manastırlara taşındı.

969’da Patrik VII. Yuhanna zamanında Malatya’ya yerleşti.

1058’de Özellikle Melkit (Krallığa mensup) Rum Ortodoksların baskı ve saldırılarından dolayı Diyarbakır’a alındı.1293 yılına kadar hem Diyarbakır hem de Deyrulzafaran manastırı merkez olarak kullanıldı.

1293 yılında Patrik İğnatiyos Bin Vahip Döneminde Patriklik merkezi sürekli ve resmen Deyrulzafaran’da kaldı.

1932 yılında Humus Metropoliti Efrem Barsavm Patrik olunca Suriye’nin Humus şehrine taşıdı.

1959’da Patrik İğnatıyos III. Yakup Patriklik merkezini Suriye’nin başkenti Şam’a aldı. Bugün Antakya Süryani Ortodoks Kilisesinin Patriklik merkezi hala Şam’dadır